Trabalho remoto

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Contexto:

Sou português serei contratado por uma empresa Alemã, com sede em Berlin.

Regime de contrato: sem termo.

Agregado familiar 3 pessoas (1casal + 1 criança)

Exercerei trabalho remotamente para esta empresa. 

Continuarei a residir em Portugal.

Como se processa, no âmbito das obrigações do contribuinte perante a Autoridade Tributária, a declaração de IRS?
Como evitar a dupla tributação?
As despesas gerais e familiares, saúde, educação, serão feitas em Portugal. Estas despesas "contam" para o cálculo das deduções no IRS?

Serei paralelamente  prestador de serviços com atividade económica aberta em Portugal. Possuo um estudio arrendado para desenvolver a minha atividade profissional. (recibo verde)

Como é possível conciliar as duas atividades em termos fiscais? Ou seja, tornar-me trabalhador por conta de outrem para uma empresa com sede na Alemanha, e continuar a passar recibos verdes em Portugal relativamente às atividades paralelas?